National Center for Biotechnology Information (NCBI)

PENDAHULUAN

National Center for Biotechnology Information (NCBI) adalah bagian dari Amerika Serikat National Library of Medicine (NLM), sebuah cabang dariNational Institutes of Health . Para NCBI terletak di Bethesda, Maryland ( 38,994994 ° N 77,099339 ° B Koordinat : 38,994994 ° N 77,099339 ° B) dan didirikan pada tahun 1988 melalui legislasi disponsori oleh Senator Claude Pepper . Para NCBI rumah genom sekuensing  data dalam GenBank dan indeks artikel penelitian biomedis dalamPubMed Central dan PubMed , serta informasi lain yang relevan dengan bioteknologi . Semua database yang tersedia secara online melalui Entrez mesin pencari.

NCBI disutradarai oleh David Lipman , salah satu penulis asli dari BLAST Program urutan alignment dan seorang tokoh yang dihormati di Bioinformatika .Dia juga memimpin program penelitian intramural, termasuk kelompok yang dipimpin oleh Stephen Altschul (lain BLAST co-author), David penghuni darat, dan Eugene Koonin (seorang penulis produktif di genomik komparatif ).

Para NCBI telah memiliki tanggung jawab untuk membuat tersedia di GenBank DNA urutan database yang sejak tahun 1992. ^[1] GenBank berkoordinasi dengan laboratorium individu dan database urutan lain seperti orang-orang dari Laboratorium Biologi Molekuler Eropa (EMBL) dan DNA Data Bank of Japan (DDBJ) . ^[2]

Sejak tahun 1992, NCBI telah berkembang untuk menyediakan database lain selain GenBank. NCBI menyediakan Warisan Mendel Online di Man , Database Modeling Molekuler (struktur protein 3D), dbSNP database polimorfisme nukleotida tunggal , Koleksi Gene Urutan unik Manusia, Peta Gene dari genom manusia , Browser Taksonomi, dan koordinat dengan National Cancer Institute untuk menyediakan Proyek Genome Kanker Anatomi. Para NCBI memberikan pengenal unik (nomor ID Taksonomi) untuk setiap spesies organisme.

Para NCBI memiliki alat perangkat lunak yang tersedia dengan WWW browsing atau melalui FTP. Sebagai contoh, BLAST adalah program yang mencari kemiripan urutan. BLAST dapat melakukan perbandingan urutan DNA terhadap database GenBank dalam waktu kurang dari 15 detik.

Para Bookshelf NCBI adalah kumpulan tersedia secara bebas, download, on-line versi buku biomedis yang dipilih. Sejak April 2011, Bookshelf telah 845 judul yang meliputi berbagai topik termasuk biologi molekuler , biokimia , mikrobiologi , menyatakan penyakit dari titik molekuler dan seluler pandang, metode penelitian, dan virologi .Beberapa buku adalah versi online dari buku yang diterbitkan sebelumnya, sementara yang lain, seperti Coffee Break (buku) , yang ditulis dan diedit oleh NCBI staf. Bookshelf adalah pelengkap Entrez PubMed repositori peer-review publikasi abstrak dalam bahwa isi Bookshelf memberikan perspektif didirikan pada bidang berkembang studi dan konteks di mana banyak potongan individu yang berbeda dari penelitian yang dilaporkan dapat diatur.